Ondřej Filip vystudoval Matematicko-fyzikální fakultu Univerzity Karlovy v Praze, obor Informatika, a University of Pittsburgh - Joseph M. Katz Graduate School of Business (MBA). Během studia na Karlově univerzitě začal pracovat ve společnosti IPEX a. s., kde později působil jako technický ředitel a člen představenstva.

Od prosince 2004 je Ondřej výkonným ředitelem sdružení CZ.NIC. Vedle výkonu své funkce v CZ.NIC působí jako předseda představenstva propojovacího uzlu NIX.CZ a též jako předseda představenstva RIPE NCC, což je registr IP adres pro Evropu, Střední východ a postkomunistické země. Ondřej je též tzv. „držitelem klíče od kořenové zóny Internetu“ neboli Trusted Community Representative u nejvyššího správce Internetu ICANN/IANA.

V minulosti Ondřej vedl i další organizace zabývající se Internetovou infrastrukturou jako Euro-IX, DNS OARC a působil jako aktivní člen rady národních domén (ccNSO council) nebo poradního výboru pro bezpečnost a stabilitu (SSAC) v rámci ICANN. Účastnil se též Multistakeholder Advisory Group, jež je poradním orgánem generálního tajemníka OSN pro Internet Governance Forum,

Ondřej Filip je od roku 2019 členem Síně slávy Cybersecurity, v níž jsou zastoupené osobnosti, které zásadním způsobem nebo dlouhodobým pozitivním přínosem ovlivnili kyberbezpečnost v České republice.

Ve svém volném čase rád hraje basketbal nebo programuje opensource software. Ondřej hovoří plynně anglicky, domluví se také německy a rusky.